《表4 部分弧菌的16S r RNA与Autof ms1000复核鉴定》

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《副溶血弧菌的MALDI-TOF MS与16S rRNA鉴定法》

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注：Autof ms1000—全自动微生物质谱检测系统；16S r RNA—16S核糖核苷酸测序。

Autof ms1000鉴定结果属与测序结果一致。16S r RNA在鉴定1～9、11～37菌株的第一匹配和第二匹配相似度差异均<0.8%，无法确定到种，可确定弧菌属。Autof ms1000鉴定1～9、11～37为副溶血弧菌，分值均>9.5，种水平可信。在质谱鉴定速度快的基础上，同时可确定为副溶血弧菌。10号菌株第一匹配结果metoecus弧菌，第二匹配结果为霍乱弧菌，其相似度差异<0.8%，无法确定到种，可确定弧菌属。10号菌Autof ms1000鉴定为霍乱弧菌，分值>9.5，种/属水平可信。10号菌株的质谱结果霍乱弧菌更加靠近测序结果，与测序第二匹配结果（霍乱弧菌，99.09%）一致，但是由于和第一匹配（99.19%）相似度仅差0.1，则不排除质谱结果是正确的。综合比对结果可知，在质谱鉴定快速简单的前提下质谱得出的菌株属水平结果与测序一致，且Autof ms1000鉴定可确定到种。挑选5株临床菌株（样品6～9、样品11）及1株标准菌株CICC 24174送广州金域医学检验中心进行16S r RNA复核测序。见表4。CICC24174菌株用Autof ms1000鉴定结果均是副溶血弧菌鉴定结果种水平置信，符合测序结果。其中样品6～9、样品11，Autof ms1000鉴定结果均是副溶血弧菌鉴定结果种水平置信符合测序结果。