《表2 桉树GBS测序数据统计》

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《基于ddGBS的桉树SNP挖掘和系统进化分析》

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基因组DNA经双酶切建库测序，去除低质量序列后，共获得30.49 Gb数据，平均每个样品的数据量为1.09 Gb。如表2所示：测序共产生210 276 036条序列，样品平均序列条数为7 509 858，14个树种产生的测序片段数存在差异，其中最多的为加拉桉，平均测序片段数为10 913 288条，最少为蓝桉，平均产生4 741 137条。测序Q30值在97.7%～98.3%范围内，平均为98.0%；GC含量为43%～47%，平均的GC含量为44%。样品间比对匹配率在46.0%～88.9%之间，平均为77.8%，其中，比对匹配率最高为尾叶桉（88.9%），最低为方格皮桉（45.0%）。各树种与巨桉平均对比匹配率在47%～49%之间的是方格皮桉和柠檬桉；在66%～84.5%范围的包括加拉桉、银顶山岑桉、四齿桉、王桉和克蒂斯桉；在86%～89%范围的是粗皮桉、赤桉、蓝桉、细叶桉、尾叶桉、邓恩桉和亮果桉。