《表3 样本测序结果统计表》

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《猪不同发育阶段肠道微生物菌群特征分析》

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25个样本均获得了质量良好的基因组DNA，同时也扩增出了符合目的片段大小的PCR产物，测序完成后，对所测数据进行质控检查。由图1可以看出，样本的Shannon和Sobs稀释曲线，当样品随机抽取的数据量为35 000左右时，曲线开始趋于平坦，表明取样深度基本一致，稀释曲线均达到平台期，包含了样本中绝大多数微生物多样性的信息。数据经优化整理后，每个处理组的数据统计结果（表3）。各组间所获得的序列条数及碱基个数经统计学检验均差异不显著，5个处理组序列长度均集中在421～440 bp(51.64%）和441～460 bp（占48.36%），每个处理组的平均长度同为440 bp。5个试验组共获得1 612个OUT，其中60日龄时获得了947个、90日龄时获得1 169个、120日龄时获得1 133个、150日龄时获得1 261个、180日龄时获得1 217个。由组物种Venn图（图2）所示，5个试验组共享了607个OTU，有4个试验组共享了338个OUT，3个试验组共享了230个OUT，2个试验组共享了213个OUT，60日龄组有85个专有OTU，90日龄组有50个专有OTU，120日龄组有16个专有OUT，150日龄组有33个专有OTU，180日龄组有36个专有OTU。