《表4 PPP3CA基因单倍型与双倍型分析》

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《PPP3CA基因多态性与江口萝卜猪肉质性能关联性分析》


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由表3可知,A-918C位点等位基因分布较均匀;而G154767A和G316451A位点等位基因频率差异大,GG为优势基因型,G为优势等位基因,等位基因频率分别为0.772 7和0.767 9,表明群体内变异程度较低,等位基因分布不均匀。3个位点PIC均为中度多态,可以提供一定的遗传信息。χ2检验显示A-918C位点和G316451A位点处于HardyWeinberg平衡,G154767A位点极显著偏离HardyWeinberg平衡,表明该位点可能存在选择或遗传漂变。2.4单倍型、双倍型分析以及连锁不平衡分析对检测到的3个SNPs位点进行连锁不平衡分析。根据D’值和r2判断位点之间是否存在连锁,其中D’=1为完全连锁,D’=0为无连锁或连锁平衡,r2=1为完美连锁,r2>0.33提示为强连锁,r2=0为无连锁或连锁平衡。由图3可知,3个位点之间无强连锁不平衡。单倍型和双倍型分析结果见表4,舍去频率低于0.03的单倍型和双倍型,共有7种单倍型和8种双倍型,其中H3(AGG)为频率最高的单倍型,H3H3为频率最高的双倍型。