《表6 各体系相互作用能分析》

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《基于计算机虚拟技术研究花椒毒素及其同分异构体对细胞色素P450的抑制作用差异》

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蛋白和小分子的结合自由能可以从能量的角度表征受体与配体之间键合的能力。结合能负值越大，表明键合能力越强，破坏该键所需能量也就越大。选取3个体系最后4 ns进行相对结合自由能计算，结果见表6。3个同分异构体化合物与CYP2A6之间的结合自由能均为负值，说明3种化合物均能与CYP2A6产生结合。将结合自由能进行分解，范德华相互作用（Gvdw）、静电相互作用（Gele）和非极性溶剂化自由能（Gesurf）均为负值，说明Gvdw、Gele、Gesurf这3种相互作用能够诱导配体受体结合，而极性溶剂化自由能（Gegb）为正值说明其不利于配体分子结合到受体蛋白中。从表中还可知，Gvdw对配体受体结合最为显著，由此可以判断，受体活性口袋中疏水性氨基酸与口袋形状互补是促成配体受体结合的重要因素。