《表2 蛋白质定量及差异表达结果》

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《高盐环境下鼠伤寒沙门氏菌差异糖蛋白富集及组学分析》

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将标记后的样品进行液质联用分析，并用Thermo Proteome Discoverer 2.2进行定性及定量蛋白质组学分析。该研究做3个实验重复，均进行非糖肽的二甲基正反标记的定量分析以及糖肽的定性分析。在每一次定量实验中，被正反标记都标记上的蛋白认为是可信蛋白（表2）。本研究认为可信蛋白表达水平变化超过1.5倍的蛋白（差异倍数>1.5或<0.66）为高盐诱导的差异表达蛋白[6]（图2）。3个定量实验重复中至少有2组重复鉴定到的差异蛋白，推测是可信的差异蛋白[8]，共有49个，对其进行KEGG功能分析，结果显示被定量的糖蛋白主要是代谢通路相关蛋白（21.51%）、核糖体相关蛋白（12.90%）、次生代谢产物的生物合成相关蛋白（12.90%）、不同环境中的微生物代谢相关蛋白（7.53%）等（图3）。推测在3组定量实验中均鉴定到的差异蛋白是可信度最高的差异蛋白，共有30个（图4）。