《表1 葡萄叶片差异表达3.0倍以上的蛋白质定量信息》

《表1 葡萄叶片差异表达3.0倍以上的蛋白质定量信息》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《多组学技术揭示葡萄叶片响应灰葡萄孢菌侵染的抗性机制》


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本研究在每一个生物学重复中都鉴定到了2 400个以上的蛋白质(图2A~B)。模拟组中3次生物学重复试验总共鉴定到3 285个蛋白质(图2A),接菌组中总共鉴定到3 481个蛋白质,取得了比较全面的鉴定结果(图2B)。在差异蛋白质定量比较中,我们采取非常严格的筛选策略,须同时满足以下2个条件:1) 某个蛋白质至少在各组样本的2次生物学重复中被鉴定到。模拟组和接菌组中分别有2 396和2 602个蛋白满足此要求,其中2 092个蛋白质在2组样本中被共同鉴定到(图2C)。2) 在差异表达蛋白质中,满足接菌组蛋白质/模拟组蛋白质>1.50或<0.67,P<0.05,CV<30%,才能被界定为显著差异表达。经过这2个条件筛选,有304个蛋白质在病菌处理后表达消失,510个蛋白质表达新增,而在2 092个共性蛋白质中只有358个蛋白质表达发生显著上调,202个蛋白质表达发生显著下调(图2C)。这些发生消失或新增的差异蛋白质和显著上下调的共性蛋白质共计1 374个,在本研究中被界定为显著差异表达蛋白质,其中差异表达3.0倍以上的共性蛋白质如表1所示。