《表1 Maxquant软件的蛋白质数据库检索参数》

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《中宁-格尔木产区宁杞一号干果蛋白质组学研究》

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将样品蛋白质的LC-MS原始数据导入Maxquant软件（版本号1.5.3.17），对检测到的蛋白质进行数据库匹配[12]，对两产地样品蛋白质的数据进行鉴定和相对表达量的比较。本研究使用的Lable-free定量算法的原理为：以一级质谱（MS1）为基础，将质谱数据转化成以色谱保留时间和质荷比（m/z）为变量的二维图谱，在该二维图谱的基础上再增加MS1中的肽段强度变量，从而将最原始的质谱数据转换成形象的三维图谱，最后利用Maxquant解析这些肽段的定量信息，从而获得对应蛋白质的相对定量比值[13-14]，而MS1中肽段的鉴别是通过Maxquant软件集成的搜索引擎Andromeda对二级质谱（MS2）的检测结果进行数据库检索实现的。Maxquant软件的蛋白质数据库检索参数如表1所示。