《表3 WNV E蛋白碱基突变率（%）》

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《亚洲西尼罗河病毒的系统发育及E蛋白分子进化特征分析》

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将中国、巴基斯坦、印度、以色列和土耳其共5株WNV的E蛋白与谱系1和谱系2 WNV代表株的E蛋白进行核酸序列和氨基酸序列比对，发现与谱系2株相比，WNV E蛋白碱基突变率和氨基酸突变率整体比谱系1高。与谱系1相比，除印度株（KU978770）外，所有其他株E蛋白的碱基突变率和氨基酸突变率与谱系1a相比最低，表明WNV谱系1a在亚洲区较为流行；而印度株（KU978770）与谱系1c株相比，其E蛋白碱基突变率与氨基酸突变率最低，分别为0.8%和0.4%，这与前面进化分析的结果一致，即印度株（KU978770）与谱系1c株在亲缘关系上最为接近，见表3和表4。将亚洲区流行的WNV株E蛋白与谱系1a比对发现，印度株（GQ851605、JX041632、GQ851604和KU-978770）的第154和156位氨基酸分别由天冬酰胺突变为天冬氨酸和丝氨酸（N154D、N154S），丝氨酸突变为脯氨酸和丙氨酸（S156P、S156A），而中国株（AY490240）、巴基斯坦株（JX070655）及以色列株（HM051416）的第156位氨基酸分别由丝氨酸突变为脯氨酸、苯丙氨酸和脯氨酸（S156P、S156F、S156P），见表5，推测这些位点的改变可能与病毒的毒力、致病性、神经侵袭性、流行等有关。