《表1 靶标拷贝数随冻融次数(或天数)变化趋势的拟合曲线主要参数》
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《微滴式数字PCR评价保存时间和冻融对细菌基因组DNA稳定性的影响》
曲线拟合采用指数回归的单相衰减模型,公式为y=(y0-plateau)*exp(-K*x)+plateau,其中,y0是x(时间)等于0时的y值,稳定段(plateau)是无限时间的y值,K是速率常数;半衰期值为ln2/K
对室温、-20℃、-40℃和-80℃的核酸检测数据,采用Graphpad Prism软件,使用指数回归的单相衰减模型进行曲线拟合,分析靶标拷贝数随冻融次数(或天数)的变化趋势(图2),主要指标值见表1。分析2种细菌核酸衰减的速率常数,室温和-80℃的2条曲线最为接近且数值较小,其次是-40℃曲线,最大的是-20℃曲线。对比核酸衰减的半衰期,室温放置时半衰期(沙门菌/志贺菌)为3.21/3.99 d,-80℃保存时为2.84/3.38次冻融,-40℃保存时为2.09/2.21次冻融,-20℃保存半衰期最短,为1.61/2.06次冻融。但是,对比不同曲线速率常数和半衰期的可信区间,只有沙门菌的室温和-20℃曲线之间的差异具有统计学显著性;其他曲线参数的可信区间互相覆盖,不同曲线之间的差异没有统计学显著性。
图表编号 | XD00208056700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.30 |
作者 | 薛盼盼、张京云 |
绘制单位 | 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |