《表2 农用微生物数据类别》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《农用微生物数据与资源关联应用研究》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

农用微生物数据是微生物数据和农业应用数据想结合的独立范畴，依据微生物生物体和作用环境，将农用微生物数据划分为两个类型数据（表2）：第一，微生物自身型生物学数据，包括培养组、基因组、转录组、蛋白质组和代谢组信息数据。微生物组（mi‐crobiome）是指包括细菌、古菌、低（高）等真核生物、病毒等微生物的基因和基因组，及其周围环境在内的全部[10]，涉及微生物培养组、DNA和m RNA信息。蛋白质组（proteome）一词最早在1994年由澳大利亚科学家Wilkins等[11]提出的，意指一个组织或细胞中的全部蛋白质由基因组表达。1995年第一篇蛋白质组学文献报道以来NCBI Pubmed数据库中已有88 300篇文献[12]。基于磁共振分析基础，英国研究者Nich‐olson等于1999年首次提出代谢组学概念[13]，主要应用于探究相对分子质量很小（<150 Da）的分子物质，后者多为糖、脂质、蛋白质代谢过程的中间产物或最终产物。这些小分子物质不仅能够说明细胞内部的生理代谢变化，也表现出细胞接受环境污染物和药物等外界因素的影响，代谢组学拥有组学研究的“终点”之称[13-14]。第二种类型的农用微生物数据为微生物关联型数据，是与微生物密切关联一些特定生态环境和功能的数据，包括两个层面，一为生态学数据，包括微生物多样性、宏基因组、宏蛋白组、宏代谢组等；二为功能型微生物数据，如根瘤菌与豆科植物互作的结瘤率、固氮效率，从枝菌根菌的侵染率等。第二、三代测序技术通量的提高和费用的下降极大地推动了微生物组领域的发展，拓宽了微生物组研究对象的深度和广度[15]。