《表4 ToCV地理结构的系统发育-性状关联检验》

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《番茄褪绿病毒的进化动态与适应性进化特征》

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RNA病毒高度变异，通过不断的变异以完成适应性进化。除了地理因素，生物因素（如寄主）也可能影响RNA病毒的适应性进化。目前研究显示马铃薯Y病毒属（Potyvirus）病毒的进化多数具有很强的地区适应性，如马铃薯Y病毒（potato virus Y，PVY）、辣椒脉斑驳病毒（chilli veinal mottle virus，Chi VMV）和夜来香花叶病毒（telosma mosaic virus，Te MV)[40-42]。然而，由于本研究涉及的To CV分离物寄主均为番茄，因此本研究仅评估地理因素对该病毒适应性进化的影响。系统发育分析与性状关联分析结果显示To CV分离物与其来源地区存在非常强的关联性（表4），表明该病毒的适应性进化也主要受地理因素所驱动，这是毛形病毒属病毒地区适应性的首次报道。但进一步的选择压力分析却未找到To CV显著发生适应性进化的氨基酸位点。究其原因，主要可能有以下两点：一是由于本研究的To CV序列数量仍然有限；二是当前用于检测正选择压力的方法，其灵敏度仍然有限（如PAML等）。