《表2 ZNF521最佳潜在靶基因的基因本体富集的生物过程结果(false discovery rete<0.02)》
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《锌指蛋白521在肾母细胞瘤的表达及转录调控预测研究》
从Cistrome DB网站检索获取到2份ZNF521相关的ChIP-seq数据,依据score>0.01,筛选得到2411个ZNF521潜在靶基因。同时,运算GTEx-TAR-GET、GSE73209、GSE11024、GSE4530、GSE2712数据集来筛选差异基因。将各个数据集进行交集处理,筛选出在不同数据集出现3次以上的差异基因,共得到1346个作为WT差异基因,其中393个上调基因和953个下调基因。将ZNF521潜在靶基因、ZNF521相关基因与WT差异表达基因三部分取交集,最终得到101个最佳潜在靶基因。通过构建PPI(P<0.001),发现网络中的FGFR1涉及泌尿生殖系统发育、胚胎发育调控等多个生物过程,且与ZNF521表达呈强相关,FGFR1转录起始位点附近有ZNF521的ChIP-Seq数据的结合信号(图4.A-C,表2)。
图表编号 | XD00202011700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.20 |
作者 | 胡师华、韦康来 |
绘制单位 | 广西医科大学第二附属医院病理科、广西医科大学第二附属医院病理科 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |