《表1 3种全基因组数据分析工具检测药品种类情况》

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《全基因组数据分析工具TB Profiler v2.8.0、Mykrobe v0.7.0和PhyResSE v1.0在耐药结核病检测中的价值》

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注“√”代表相对应的分析工具可以检测该药品的耐药性；“-”代表相对应的分析工具不可以检测该药品的耐药性；INH：异烟肼；RFP：利福平；PZA：吡嗪酰胺；EMB乙：胺丁醇；FQ：氟喹诺酮类；Bdq：贝达喹啉；Lzd：利奈唑胺；Cfz：氯法齐明；Am：阿米卡星；Sm：链霉素；Eto：乙硫

评估的3种结核分枝杆菌全基因组数据分析工具分别是TB Profiler v2.8.0(http：//tbdr.lshtm.ac.uk/）、Mykrobe v0.7.0(https：//www.mykrobe.com/）和PhyResSE v1.0(www.phyresse.org）。下文中所涉及的TB Profiler、Mykrobe和PhyResSE均与此处版本相同。这3种工具都不需要使用命令行界面和编程语言，只需把原始测序数据上传到网页或导入软件即可检测所有一线抗结核药品和大多数二线抗结核药品的耐药性，具体药品目录见表1。