《表2 炭样小单孢菌JXNU-1中TCS蛋白分布及数目》

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《炭样小单孢菌JXNU-1双组分信号转导系统的生物信息学分析》

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根据PFAM数据库中的HK （HATPase＿c，Pfam-02518）和RR（Response＿reg，Pfam00072）结构域信息分析炭样小单孢菌JXNU-1中的所含有的TCS，并通过与NCBI数据库中其他蛋白序列进行比对，确定TCS、孤儿HK和孤儿RR的数目。结果表明，炭样小单孢菌JXNU-1共含有85个TCS蛋白，其中HK蛋白有38个，这38个HK蛋白相对应的基因中有17个与编码RR蛋白的基因相邻并配对，说明炭样小单孢菌JXNU-1中的所含有的TCS （HK-RR）有17对。除去上述17对蛋白外，孤儿HK有21个，RR蛋白有46个，同样地，除去能够与HK配对的RR，孤儿RR有29个。此外，还发现3个杂合的TCS蛋白（表1）。炭样小单孢菌JXNU-1基因组大小为7 635 725 bp，GC含量为73.85%。该菌基因组编码6 444个CDS。物种基因组大小与所含TCS数目存在一定相关性，一般基因组越大，TCS数量越多（Borland et al.，2015）（表2）。