《表2 Os RZFP34启动子上与逆境响应相关的主要顺式作用元件》
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《水稻OsRZFP34基因逆境表达特征及其启动子的克隆与分析》
核心序列中B代表C、G、T;N代表A、C、G、T;M代表A、C;R代表A、G;V代表A、C、G;W代表A、T;Y代表C、T。“+”表示正链;“–”表示负链。
通过New PLACE和Plant CARE在线分析Os RZFP34启动子区域1 951 bp序列,发现该启动子区域包含了大量与胁迫响应、激素响应相关的顺式作用元件(表2)。这些元件主要包括参与热激响应和调控的元件CCAAT–box(CCAAT)10个和GATA–motif(WGATAR)6个;参与低温胁迫响应的相关元件MYCCONSENSUSAT(CANNTG)6个、LTRECOREATCOR15(CCGAC)和CBFHV (RYCGAC)各1个;参与干旱/脱水胁迫响应的元件MYB1AT(WAACCA)6个,ACGT元件(ACGT)和MYBCORE(CNGTTR)各5个,CRT/DRE(RCCGAC)和MYCATERD1(CATGTG)各1个;参与ABA响应的元件ABRE(ACGTG)3个和DPBFCOREDCDC3(ACACNNG)4个;参与病菌和盐胁迫响应的元件GT1GMSCAM4(GAAAAA)6个;与茉莉酸响应相关的顺式元件CGTCA-motif(CGTCA)4个、GCCCORE(GCCGCC)和T/GBOXATPIN2(AACGTG)各2个;与生长素响应相关的元件Aux RR–core(GGTCCAT)、CATATGGMSAUR(CATATG)、TGA–element(AACGAC)各1个;GA响应相关元件CAREOSR E P1(C AACTC)1个和GARE–motif(TCTGTTG)2个;参与Ca2+信号转导相关的元件CGCG–box(VCGCGB)5个和ABRERATCAL(MAC GYGB)2个;此外,还存在1个损伤胁迫响应相关元件W–box (TGACY)和1个胁迫响应元件STRE(AGGGG)。
图表编号 | XD00194601100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.25 |
作者 | 邹杰、刘媛 |
绘制单位 | 宜春学院生命科学与资源环境学院、江西省作物生长发育调控重点实验室、宜春职业技术学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |