《表1 番茄和马铃薯中lnc RNA的分类及数量》

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《嫁接番茄长链非编码RNA(lncRNA)的鉴定》

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注:整数代表该类lnc RNA的数量，百分数代表所占比例

本研究对嫁接番茄转录组数据进行分析，在番茄（接穗）和马铃薯（砧木）中分别鉴定出3 360和5 657个lnc RNA。根据lnc RNA在参考基因组位置分为四类（Ponting et al.，2009）：基因间lnc RNA （Intergenic lnc R-NA）、内含子lnc RNA （Intronic lnc RNA）、反义lnc RNA（Antisense lnc RNA）和正义lnc RNA （Sense lnc RNA）。在番茄中鉴定出2 869个基因间lnc RNA，178个内含子lnc RNA，163个反义lnc RNA和150个正义lnc RNA。在马铃薯中鉴定出4 667个基因间lnc RNA，354个内含子lnc RNA，542个反义lnc RNA和94个正义lnc RNA，番茄和马铃薯中分别有85.39%和82.50%的lnc RNA是来自基因间lnc RNA （表1）。