《表3 砧木(马铃薯)移动到接穗(番茄) lnc RNA的靶基因》

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《嫁接番茄长链非编码RNA(lncRNA)的鉴定》

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基于接穗（番茄）中可表达的基因（m RNA）位点，由接穗（番茄）移动到砧木（马铃薯）的6个移动lnc R-NA位点的上下游搜索到26个靶基因，将其与砧木中表达的基因进行同源搜索，最终在砧木中得到16个同源靶基因，将其定义为6个可移动lnc RNA在砧木（马铃薯）中的靶基因（表2）。其中，可移动lnc RNA（XLOC＿024505）在源组织（番茄）中寻找到7个靶基因，通过同源搜索，在砧木中搜索到4个同源靶基因（PGSC0003DMT400047329，PGSC0003DMT400047-261，PGSC0003DMT400047178，PGSC0003DMT400-047273）。同时，基于砧木（马铃薯）中可表达的基因位点，在砧木（马铃薯）移动到接穗（番茄）的3个移动lnc RNA位点搜索到13个靶基因，与接穗中表达基因同源搜索，在接穗中得到8个同源靶基因，将其定义为3个可移动lnc RNA在接穗（番茄）中的靶基因（表3）。GO分析表明，由接穗（番茄）移动到砧木（马铃薯）的lnc RNA可能参与马铃薯囊泡运输、有丝分裂和酶活性等过程（图6A）。其中，移动lnc RNA （XLOC＿024505）在砧木（马铃薯）中可能参与调控细胞过程，对刺激的响应和生物调节等生物过程。由砧木（马铃薯）移动到接穗（番茄）的lnc RNA可能参与蛋白质氧化还原反应、细胞活动和生物过程等番茄植株生命活动调控（图6B）。