《表1 菌群真菌类微生物多样性指数表》
注:表中第一列为样本名,之后各列分别对应每个样本在相同测序深度下的Chao1、ACE、Shannon、Simpson等多样性指数计算结果。表中不同大写字母表示各处理间同一指标下的差异极显著(p<0.01),下同。
对于微生物群落而言,有多种指数来反映其Alpha多样性。不同的指数对于衡量群落多样性的侧重点各不相同,有些更侧重于体现群落的丰富度(即群落中微生物成员如OTU的数量),有些更倾向于反映群落的均匀度(即各成员间的丰度差异大小),也有一些多样性指数则综合考虑了以上两方面的因素[14]。Chao1指数和ACE指数侧重于体现群落丰富度,由表1可知A、B、C组Chao1和ACE的指数值非常高,达到了550以上,说明这3组真菌群落的丰富度较高,而D、E组群落的丰富度则相对较低,相对于其它3组均极显著性降低(p<0.01),这与图2所表现出的趋势结果一致。Shannon多样性指数(Shannon diversity index,或称为Shannon-Wiener、Shannon-Weaver指数)综合考虑了群落的丰富度和均匀度。Shannon指数值越高,表明群落的多样性越高。Simpson多样性指数(The Simpson index,l)也是评价群落多样性的常用指数之一,由Edward Hugh Simpson提出[15]。Simpson指数值越高,表明群落多样性越高。一般而言,Shannon指数对群落的丰富度以及稀有OTU更敏感,而Simpson指数对均匀度和群落中的优势OTU更敏感。由表1可知,同样除D、E组Shannon、Simpson值相对较低外,其余三组均较高。说明D、E组的种类相对较少。
图表编号 | XD00192583100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.20 |
作者 | 石浩、王仁才、王芳芳、庞立、王琰、卜范文、周倩 |
绘制单位 | 湖南农业大学园艺园林学院、湖南应用技术学院农林科技学院、湖南农业大学植物保护学院、湖南农业大学园艺园林学院、湖南农业大学植物保护学院、湖南农业大学园艺园林学院、湖南农业大学植物保护学院、湖南农业大学园艺园林学院、湖南农业大学植物保护学院、湖南农业大学园艺园林学院、湖南农业大学东方科技学院、湖南省园艺研究所、湖南农业大学园艺园林学院、湖南农业大学植物保护学院 |
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