《表1 实验所用ONT数据统计》

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《基于深度学习的第三代基因测序一致性序列生成》


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a数据来源:E.coli和Fly数据下载自NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra),索引号分别是ERR1147230和SRR6702603,Yeast数据下载自http://www.genoscope.cns.fr/externe/Download/Projets/yeast/datasets/raw_data/S288C/

引入深度学习方法进行一致性序列生成任务,首先要对原始数据预处理,使其适合作为人工神经网络的输入。本研究中采用的数据集为公共数据库中的Oxford Nanopore Technology公司的纳米孔测序数据(即第三代基因测序ONT数据),选取的模式物种包括大肠杆菌、酵母菌以及果蝇,数据集的具体信息见表1。