《表1 鳗鲡养殖环境微生物基因组中注释的抗生素抗性基因》

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《宏基因组学揭示鳗鲡养殖环境微生物抗性基因的赋存特征》


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将鳗鲡养殖环境中底泥和养殖水的基因组数据上传ARDB抗性基因数据库进行ARGs的预测和注释,底泥和养殖水分别注释得到ARGs序列6 570条和19 356条,对鳗鲡养殖环境中的抗性基因类型进行统计分析(表1)。从表1可知,底泥的ARGs数量比养殖水低,但ARGs种类比养殖水高。同时,在养殖环境介质(底泥和养殖水)中的丰度较高的抗性类型均为四环素类、杆菌肽类和磺胺类抗生素,表明在鳗鲡养殖过程中,出现耐四环素、杆菌类以及磺胺类病原菌的机会相对较高。