《表3 大肠杆菌(E.coli str.K-12 substr.MG1655)满足宽松阈值的新基因》

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《基于序列相似性和Z曲线方法重注释原核生物蛋白编码基因》

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将没有提供明确功能的ORFs作为测试集可寻找过度注释为基因的序列。预测为非蛋白编码基因的序列且同时没有在公共数据库中找到表达数据的假定ORFs将被归为过度注释为基因的序列。基因的表达数据来自不同的RNA测序集和GEO数据集（附表3），这些数据可以帮助排除掉具有表达数据的基因。