《表1 异齿裂腹鱼CLOCK蛋白氨基酸组成》

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《异齿裂腹鱼(Schizothorax oconnori)CLOCK蛋白结构和功能的生物信息学分析》

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通过ExPASy数据库中ProtParam工具分析，CLOCK蛋白分子式为C4389H6978N1278O1405S37，相对分子量101315.62Da，其氨基酸组成见表1，其中含有谷氨酰胺146个，含量最高，占到整个序列的14.2%，没有吡咯氨基酸和硒半胱氨酸，色氨酸的含量最低，为0.6%，CLOCK的半衰期为30 h，不稳定系数为68.37，属不稳定蛋白，带负电荷的氨基酸（Asp+Glu）为80个，带正电荷的氨基酸（Arg+Lys）为73个，理论上的等电点（PI）为6.44，属于酸性蛋白质，脂肪系数为69.96，亲水性平均值为-0.679。有24个丝氨酸磷酸化修饰位点（图1a），存在多个O型糖基化修饰位点（图1b）。ExPASy数据库Prort Scale工具分析显示，CLOCK蛋白最强亲水位点在第34位谷氨酸，分值-3.667，疏水性最强位点在244位丙氨酸，分值2.067，图1c显示了CLOCK蛋白所有氨基酸的亲疏水性，整体上亲水性氨基酸多于疏水性氨基酸，CLOCK蛋白属于亲水性蛋白。