《表2 分子对接后13种类二恶英类PCBs拉曼振动强度及其频率Tab.2 Raman vibration intensity and frequency of dioxin-like PCBs aft

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《基于分子对接的类二恶英类多氯联苯的拉曼光谱增强》

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13种类二恶英类PCBs与BPha酶经分子对接后，提取其对接后分子结构，对其进行拉曼振动光谱计算，结果见表2。比较分子对接前后的拉曼振动强度发现，PCB-81、PCB-105、PCB-114、PCB-118、PCB-156、PCB-170、PCB-180的拉曼振动均有所增强，其增强幅度在2.9%~213.98%之间，其中PCB-170的增强幅度最大。对接前后的拉曼光谱频率在1 631.57~1 651.94 cm-1之间，与对接前的拉曼光谱频率相比，整体发生蓝移。拉曼强度提升，其对应的频率值降低，发生一定程度的蓝移；拉曼强度下降，其对应的频率值升高，发生一定程度的红移。PCB-77的拉曼振动强度降低幅度最大（-76.20%），说明PCB-77与Bpha酶的对接效果最好。观察其打分函数为最高（3.95），即低氯取代（一至四氯）的PCBs好氧生物降解效果较好，这与Nabavi等的研究结果一致[19]。上文观察其特征振动为苯环变形，因此本文选取二面角为结构变量进行分析。观察对接前后的二面角变化发现，PCB-81、PCB-105、PCB-114、PCB-118、PCB-156、PCB-170、PCB-180经分子对接之后，其二面角均减小，其中PCB-170的二面角减小49°，减小幅度最大，其拉曼振动强度增强最大；PCB-114、PCB-123、PCB-126、PCB-157对接后的拉曼振动强度增降幅较小，变化不明显，其主要原因为PCB-114、PCB-123、PCB-126、PCB-157对接后的二面角变化程度较小，导致拉曼振动强度增降幅不明显。因此推断，二面角的变化程度越大，其拉曼振动强度增降幅越大，且随二面角逐渐减小，拉曼强度逐渐增大。PCB-105、PCB-114、PCB-118、PCB-156、PCB-170、PCB-180的苯环上邻位均有氯原子取代，邻位的C—Cl键对PCBs的二面角有很大影响，分子对接后会较大程度地改变其空间构型，导致其拉曼振动强度增大。