《表2 各组小鼠肠道菌群样本多样性指数比较》

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《高通量测序研究中药复方对流感病毒感染小鼠肠道菌群的影响》

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通过单样本Alpha多样性分析反映微生物群落的丰富度和多样性，包括一系列统计学分析指数估计环境群落的物种丰度和多样性。反映群落丰富度（community richness）的指数有Ace指数、Chao指数、Sobs指数；反映群落多样性（community diversity）的指数有Shannon指数、Simpson指数；反映群落覆盖度（community coverage）的指数有Coverage指数。上述指数中，Shannon指数值越大，说明群落多样性越高；Simpson指数值越大，说明群落多样性越低；Coverage指数是各样本文库的覆盖率，其数值越高，则样本中序列被测出的概率越高，而未被测出的概率越低，该指数反映本次测序结果是否代表样本中微生物的真实情况。各样本多样性指数见表2。对比感染流感病毒小鼠和正常小鼠发现，随着时间的变化，尤其是第7日，各样本数呈现不同程度的变动。说明小鼠感染流感病毒后，肠道菌群比例、菌群丰富度和多样性发生变化。