《表2 5例预测错误样本的预测及实际检验结果》
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《EA-YPredictor:基于Y-STR数据的家系特异性单倍群归属判别分析软件》
为了评价该软件的准确度,本研究选取了70份新的千人基因组计划东亚人群数据验证单倍群细支预测的准确性(数据尚未发表,故不全部列出)。其中准确判断的有65份,未能准确判断的5份原始数据见表2。对于70份东亚人群数据的检测结果显示的单倍群细支预测准确度为92.8%(95%置信区间:[84.1%,97.6%]),适用于辅助家系单倍群判断。从表中可见,样本GH320实际单倍群为J1,由于参考数据库中没有任何J类单倍群数据,故无法准确判断。样本GH323和HZJ1980虽然能够定位到单倍大群甚至亚群,但由于该样本是罕见的独特单倍群,在参考数据库中没有近似,也未能准确判断。而样本GH348和HZJ1981都属于单倍群R1b1b1,其祖先型单倍群R在参考数据库中数据量很少,所以被错误归类到单倍群O2a中。
图表编号 | XD00175634700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.15 |
作者 | 殷才湧、孙辉、周怀谷、金力、李士林 |
绘制单位 | 复旦大学生命科学学院人类学与人类遗传学系、复旦大学生命科学学院现代人类学教育部重点实验室、复旦大学人类表型组研究院、公安部物证鉴定中心、上海市刑事科学技术研究院、复旦大学生命科学学院人类学与人类遗传学系、复旦大学生命科学学院现代人类学教育部重点实验室、复旦大学人类表型组研究院、复旦大学泰州健康科学研究院、复旦大学生命科学学院人类学与人类遗传学系、复旦大学生命科学学院现代人类学教育部重点实验室、复旦大学人类表型组研究院、复旦大学泰州健康科学研究院 |
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