《表3 各试验材料SSR正交实验打分结果Table 3 Scores of orthogonal experiment for different test material》
注:a、b、c、d分别指LW1、LW2、LW23,“三星”。Note:a,b,c,d refers to the LW1,LW2,LW23,‘Sanxing’respectively.
对4份材料在不同SSR-PCR反应体系下的扩增效果(图2~5)进行量化打分,将目标条带清晰、特异性好且没有引物二聚体的计最高分16分,效果最差的记为1分。根据得分情况进行统计分析,结果见表3。可知,酸枣LW1的基因组DNA扩增效果较好的反应体系依次为8号、6号和11号,酸枣LW2的基因组DNA扩增效果较好的反应体系依次为6号、7号、1号,酸枣LW23效果较好的依次为5号、6号和1号,大枣“三星”的效果较好的依次为5号、1号和15号。在3个酸枣品系中,6号组合均表现出较好的扩增效果,在16个组合中3个酸枣品系的平均值最高,所以6号组合为酸枣的最佳反应体系,即总体系20μL,其中DNA模板100 ng,Mg2+浓度1.25mmol·L-1,dNTPs 0.3 mmol·L-1,引物浓度0.5μmol·L-1,Taq DNA聚合酶1.5U;大枣“三星”的效果最佳的组合为5号,即总体系20μL,其中DNA模板100 ng,Mg2+浓度1.00mmol·L-1,dNTPs 0.35mmol·L-1,引物浓度0.4μmol·L-1,Taq DNA聚合酶2.0 U。酸枣与大枣对比,二者最佳体系不同,除DNA模板用量相同外,在Mg2+浓度、dNTPs浓度、引物浓度、Taq DNA聚合酶用量上均有一定差异。
图表编号 | XD001716400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.06.30 |
作者 | 常婧、刘青柏、刘明国 |
绘制单位 | 沈阳农业大学林学院、辽宁省森林经营研究所、沈阳农业大学林学院、沈阳农业大学林学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |