《表2 Vi PR数据库已收录的病毒信息(数据来源于https://www.viprbrc.org/brc/home.spgdecorator=vipr)》

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《基因组学技术在病毒鉴定与宿主溯源中的应用》

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病毒–宿主数据库（Virus-Host Database，Virus-Host DB）和病毒病原体数据库和分析资源（Virus Pathogen Database and Analysis Resource，Vi PR）整合Ref Seq、Gen Bank、Uni Prot、Viral Zone等多个数据库，对病毒信息进行了分类汇总。Virus-Host DB针对的是已知宿主信息的病毒种类，约11，000多种（序列14，000多条），根据宿主种类进行分类（包括动物、植物、其他真核生物以及细菌、古生菌），提供病毒全基因组与其宿主信息的分类链接，其中人类病毒1，300多种。Vi PR则是对人类病毒病原体及其相关病毒进行汇总，包含20多个病毒科，对每个病毒科的基因组数量以及蛋白数量、菌株数量和未知宿主比例等进行整理与统计（表2）。根据Vi PR的统计，人类病毒病原体及其相关病毒中存在相当比例的未知宿主信息的病毒种类。除上述病毒库外，其他很多病毒数据库大都限于某个子集，比如流感病毒数据库、RNA病毒数据库、LANL出血热病毒数据库、乙型肝炎病毒数据库等（Dong et al，2017）。虽然Virus-Host DB与Vi PR从病毒与宿主关联性的角度对病毒的宿主信息进行汇总，但是动物源病毒多样性高，病毒与宿主的互作关系较为复杂，可能存在多重中间宿主或宿主转移，为确定病毒与宿主复杂的关联关系带来了巨大挑战。在此背景下，对病毒多样性及其与宿主的关联信息进行广泛的本底调查势在必行。