《表1 数据预处理表格:Cidec基因敲除小鼠肠道菌群的特征》

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《Cidec基因敲除小鼠肠道菌群的特征》


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对小鼠粪便基因组16S r RNA的V4区进行扩增,并将纯化后的产物通过使用Illumina Hi Seq PE250进行测序,所得到的双端reads数即为PE Reads,经过拼接以及进一步过滤优化得到Clean Tags,最后过滤嵌合体后得到Effective Tags即有效序列数用于后续分析。数据处理过程中各步骤得到的统计结果见表1。其中每个样品均得到48000条以上的有效数据,原始数据的有效率均达到90%以上。