《附表1 NCBI丁酸梭菌和相似种的来源信息及基因组概况》
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《基于比较基因组学的丁酸梭菌遗传多样性及生物学特性》
注:“/”表示无样本信息
基于全基因组序列比较分析丁酸梭菌的遗传多样性,包括9株实验室分离得到的菌株与25株NCBI数据库中已知的丁酸梭菌菌株(附表1,http://doi/org/10.13995/j.cnki.11-1802/ts.023385)。如图1所示,同源性分析结果显示,34株丁酸梭菌共有346个同源基因,包括用于次生代谢产物的生物合成、氨基酸和碳水化合物转运、代谢等基因,以及大量未知功能的基因。每个菌株的特有基因个数为4~1 501个,特有基因个数占该菌株的总基因数为6%~29%,表明菌株之间存在明显差异。其中来自NCBI库中的菌株INCQS635、NEC8和DORA_1特有基因数量与其他菌株差别较大。本实验分离得到的9株丁酸梭菌的特有基因个数为24~109。其中FHLJZD47样品分离得到4株菌的总基因数在4 006~4 203,特有基因数在23~68,即同一样本分离的不同菌株基因组存在差异。
图表编号 | XD00170953700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.05.25 |
作者 | 易至、丁洁琼、王鸿超、陆文伟、赵建新、陈卫、张灏 |
绘制单位 | 江南大学食品学院、江南大学食品学院、江南大学食品学院、江南大学食品学院、国家功能食品工程技术研究中心、江南大学食品学院、国家功能食品工程技术研究中心、江南大学食品学院、国家功能食品工程技术研究中心、江南大学食品学院、国家功能食品工程技术研究中心 |
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