《表1 样本alpha多样性分析指数》

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《贝莱斯芽胞杆菌3A3-15菌株对盆栽大豆土壤细菌群落结构的影响》


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对测序序列进行随机抽样,以抽到的序列数与其所能代表OTUs的数目构建曲线(Amato et al.,2013)。以稀释曲线衡量样本的取样深度情况,当稀释曲线趋向于X轴平行时,说明取样的数量充足,更多的取样可能只产生少量新的OTUs;反之则表明继续取样还可能产生较多新的OUTs。从图2可以看出,物种数量随着测试深度的不断增加而逐渐增多,最后趋于平缓,说明绝大多数菌群被覆盖,达到平台期说明有少量细菌未被测出;结合样本覆盖率(goods_coverage)(表1)均大于96%的结果,说明该测序可以较全面地反应细菌群落多样性。