《表2 海金沙属与其它蕨类植物rpoC1编码序列(CDS)进化速率检验》

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《蕨类植物rpoC1内含子缺失及其分子进化速率》

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Et:转换数；Ev:颠换数；trst:转换率；trsv:颠换率；dN:非同义替换率；dS:同义替换率；ω:dN/dS

使用HyPhy软件局部参数下核苷酸HKY85替换模型和密码子MG94×HKY85＿3×4模型计算海金沙属和其它蕨类rpoC1外显子的进化速率（附录3），大部分蕨类d N值小于d S，trsv值小于trst。用似然比检验判断海金沙属和其它蕨类的替换速率是否存在显著差异。似然比检验的P值及Mann-Whitney检验值如表2所示。其中，海金沙属rpoC1 CDS的trst均值和trsv/trst均值大于其它蕨类植物。在似然比检验中，仅有trst、trsv以及dN的P值小于0.05，说明海金沙属rpoC1 CDS在转换率、颠换率以及非同义替换上与其它蕨类植物有显著差异。Mann-Whitney秩和检验值均无显著差异，与似然比检验结果相差较大，推测原因是海金沙属样本量少（仅2个），秩和检验误差大。