《表4 红心杉二代种子园遗传多样性的SSR分析》

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《基于转录组测序的陈山红心杉EST-SSR开发及应用》

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用筛选出11个EST-SSR标记和来自文献[13]的3个EST-SSR标记（LX-13、LX-18、LX-55）对陈山红心杉二代种子园32个杉木无性系进行遗传多样性分析（表4）。图2为引物H33扩增的荧光电泳图。开发的11对引物中，有4对引物的PIC大于0.5，说明这4对引物为高信息含量的引物。14对引物共扩增得到62个等位基因，等位基因范围为3～7个，平均等位基因数是4.4个，其中，引物H245、LX-18等位基因数最多，为7个，H7、H8、H33、H193、LX-13等位基因数最少，均为3个。有效等位基因范围为1.814 4～3.457 1，平均有效等位基因是2.4个。位点多态信息含量（PIC）变动幅度为0.373 0～0.660 0，平均为0.492 0。平均观察杂合度和期望杂合度分别为0.533 5和0.563 8，计算得出固定指数F为0.054，说明存在纯合子过量现象，但不明显。Shannon多样性指数为1.003 4，说明红心杉二代种子园的遗传多样性较高。