《表1 各类部分典型信号通路及其差异表达基因组成》
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《基于RNA-Seq技术分析江西豆豉对肠上皮细胞基因差异表达的影响》
注:粗斜体表示该基因显著差异表达
筛选各类部分典型信号通路,对涉及的差异表达基因组成进行分析(表1),其中40个显著差异表达基因以下划线标示。在免疫系统相关信号通路中,大量差异表达基因富集在“ko04060:Cytokine-cytokine receptor interaction”“ko04670:Leukocyte transendothelial migration”“ko04660:T cell receptor signaling pathway”等中。在细胞粘附相关信号通路中,差异表达基因主要集中在“ko04810:Regulation of actin cytoskeleton”“ko04510:Focal adhesion”“ko04530:Tight junction”“ko04520:Adherens junction”等中。同时,“ko04010 MAPK signaling pathway”“ko04012Erb B signaling pathway”“ko04630 Jak-STAT signaling pathway”等多个差异表达基因的信号通路参与细胞增殖、分化、迁移、存活等调控途径。而且,功能归类结果还显示与神经系统相关如“ko04360:Axon guidance”“ko04726 Serotonergic synapse”等,以及与胰岛素-糖尿病相关如“ko04910:Insulin signaling pathway”“ko04920:Adipocytokine signaling pathway”“ko04930:Type II diabetes mellitus”等两类信号通路。此外,归类时还发现存在多个与食源性致病菌相关的信号通路,如“ko05132:Salmonella infection”“ko05130:Pathogenic Escherichia coli infection”“ko05100:Bacterial invasion of epithelial cells”“ko05150:Staphylococcus aureus infection”等。
图表编号 | XD00159836700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.08.28 |
作者 | 谭强来、曾臻、武晓丽、徐锋 |
绘制单位 | 厦门医学院天然化妆品福建省高校应用技术工程中心、厦门医学院海洋生物医药资源福建省高校应用技术工程中心、厦门医学院天然化妆品福建省高校应用技术工程中心、厦门医学院海洋生物医药资源福建省高校应用技术工程中心、江西中医药大学基础医学院、南昌大学中德联合研究院 |
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