《表1 5味中药PPI网络体系的拓扑学参数》

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《利用网络药理学方法探讨针对新型冠状病毒肺炎以ACE2为治疗靶点的5味中药的作用机制和组分配伍》


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为了能够系统性地揭示上述5种中药的药理作用机制,进一步构建了PPI网络体系。首先使用STRING蛋白-蛋白互作在线预测数据库,分别将上述5种中药对应的潜在药物治疗靶点依次输入并进行分析,置信度分值设置为0.700,待生成tsv格式结果后,将其导入CytoScape 3.2.1完成结果可视化,具体结果见表1。考虑到上述5种中药对应的潜在药物靶点在PPI网络体系中的数量及关系较为复杂,因此继续使用Cytoscape 3.2.1软件中的MCODE插件进行复杂PPI网络体系的核心子网络提取处理,将选择出分值排名最高的5个核心子网络用于后续的功能及通路富集分析,5味中药PPI网络体系的拓扑学参数见表1。与此同时,每个核心子网络中按照所处体系核心度排名前10位的靶点结果见表2、图2。