《表2 文心兰25条pre-miRNAs及15条成熟体》
为了解文心兰pre-miRNAs及成熟体序列特性,本研究从文心兰转录组和miRNA数据库中筛选文心兰miRNA 31条前体,扣除重复序列,共获得分布于13个家族的25条pre-miRNAs序列,并根据其在unigene中的位置命名(表1)。在这13个premiRNAs家族中,miR398、miR535和miR2950家族各含2个基因座,而miR162、miR167和miR396家族均含有3个基因座,miR168家族含4个基因座。这25条pre-miRNAs序列长度在259(miR2950-unigene0006151)~883nt(miR169-unigene0022341)间,其GC含量在29.0%~40.0%之间。另外,从文心兰转录组数据库和miRNA文库中筛选获取分布于13个家族的15条成熟体序列(表2)。
图表编号 | XD0015676000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.09.01 |
作者 | 王培育、王丛巧、张舒婷、王雪晶、叶炜、赖钟雄、林玉玲 |
绘制单位 | 福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所 |
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