《表1 不同地区白三叶MSAP条带类型分析》
注:总甲基化率=[(Ⅱ+Ⅲ+Ⅳ)]/(Ⅰ+Ⅱ+Ⅲ+Ⅳ)]×100%;全甲基化率=[(Ⅲ+Ⅳ)]/(Ⅰ+Ⅱ+Ⅲ+Ⅳ)]×100%;半甲基化率=[(Ⅱ)/(Ⅰ+Ⅱ+Ⅲ+Ⅳ)]×100%;DS:独山;HZ:赫章;QL:晴隆;YJ:印江;CJ:从江;TZ:天柱
本研究用最终选择出的24对MSAP选扩增引物对酶切后的6个白三叶样本进行扩增,共扩增产生7 643个位点,得到基因组DNA甲基化的部分MSAP扩增图谱(图1)。在全部扩增位点中,检测出6个样本的总甲基化位点分别为DS 1 386个、HZ 1 287个、QL 1 354个、YJ 1 236个、TZ 1 330个、CJ 1 332个,6个样本中DS地区白三叶DNA总甲基化水平最高,比例为73.37%,YJ地区白三叶DNA总甲基化水平最低,为65.43%。全甲基化位点分别为DS 1 045个、HZ 940个、QL 1 045个、YJ 956个、Z 970个和CJ1 024个,其中DS全甲基化率最高55.32%,HZ地区最低为49.76%。TZ地区半甲基化率最高19.06%,YJ最低为14.82%,表明不同地区白三叶DNA甲基化均以全甲基化为主,即内侧胞嘧啶甲基化。
图表编号 | XD00156634800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.25 |
作者 | 王子苑、舒健虹、陈莹、王茜、陈光吉、吴佳海、王小利 |
绘制单位 | 贵州省草业研究所、贵州省草业研究所、贵州省草业研究所、贵州省草业研究所、贵州省草业研究所、贵州省草业研究所、贵州省草业研究所 |
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