《表1 22株珊瑚礁沉积物细菌的物种多样性》
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《Khai岛和Pathiu岛珊瑚礁沉积物细菌多样性及细菌粗提物延缓秀丽隐杆线虫衰老活性研究》
注:2株活性菌株(GXIMD112和GXIMD014)的16S r RNA基因序列提交到Gen Bank数据库得到Gen Bank登录号,其他菌株未获得Gen Bank登录号
采用6种分离培养基,从4种样品中分离得到35株细菌,进行16S r RNA基因扩增和序列分析,根据菌落形态特征及基因序列测序结果去冗余,最终从35株细菌中选取22株细菌进行16S r RNA基因序列的系统多样性分析。结果如表1和图1所示,22株菌分别属于4个大的系统发育类群:厚壁菌门(Firmicutes,31.82%)、变形菌门(Proteobacteria,54.55%)、放线菌门(Actinobacteria,9.09%)和拟杆菌门(Bacteroidetes,4.54%)。其中有4株菌属于葡萄球菌属(Staphylococcus),占所分离菌株总数的18.19%,为优势菌属。根据22株细菌及其参比细菌16S r RNA基因序列构建了N-J系统进化树(图1),4种样品中分离得到2株细菌的16S r RNA基因序列与其最近缘的典型菌株序列相似性低于98.65%,其中菌株GXIMD144与有效发表菌株Aestuariibacter aggregatus WH169T (保藏号:FJ847832)、GXIMD003与有效发表菌株Alteromonas marina SW-47T (保藏号:AF529060)发育关系最为密切,其相似性分别为96.68%和97.93%,结合Kim等(2014)的潜在新属或新种的归类原则,初步判断以上2株细菌可能为潜在新细菌物种。
图表编号 | XD00153433400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.01 |
作者 | 韩敏敏、李蜜、刘昕明、刘永宏、龙超、钟振国、易湘茜、高程海 |
绘制单位 | 广西中医药大学海洋药物研究院广西中医药科学实验中心药学院、广西中医药大学海洋药物研究院广西中医药科学实验中心药学院、广西壮族自治区海洋研究院、中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室、中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室、广西中医药大学海洋药物研究院广西中医药科学实验中心药学院、广西中医药大学海洋药物研究院广西中医药科学实验中心药学院、广西中医药大学海洋药物研究院广西中医药科学实验中心药学院 |
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