《表2 半干旱区锡林河系统沉积物/土壤细菌谱系及厌氧菌科中所有物种的丰度分布》

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《水分驱动半干旱区河流沉积物/土壤厌氧绳菌群落的空间异质性》

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沉积物/土壤样品宏基因组DNA提取按照Fast DNA?SPIN Kit for Soil说明进行。用16S r RNA基因V3-V4区引物进行PCR扩增，引物为338F（5′-ACTCCTACGGGAGGCAGCA-3′)和806R（5′-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3′）。PCR反应体系和条件参见文献[18]。所有样品的PCR产物经纯化和定量后送往北京百迈客生物科技有限公司，Illumina Mi Seq PE300测序平台进行高通量测序[18]。全部样品16S r RNA基因序列已上传至NCBI，登录号为SRR8835404-SRR8835447。34个样品共获得3 115 787条优质序列（459 bp），先运用UPARSE软件在97%相似性水平上聚类为43 830个可操作分类单元（operational taxonomic unit，OTU），再运用RDP classifier软件对上述OTU进行分类学（门、纲、目、科、属、种）注释获得791种细菌，最后运用SILVA数据库将34个样品获得的791种细菌在每个样品中分配的细菌种类及其种类对应的序列数进行物种组成的划分和相对丰度的计算[18]。从791种细菌中选择来自厌氧绳菌科（Anaerolineaceae）6个属中的15种细菌进行研究。这15种细菌来自绿弯菌门(Chloroflexi）厌氧绳菌纲（Anaerolineae）厌氧绳菌目（Anaerolineales）厌氧绳菌科（Anaerolineaceae）（表2）。目前能被明确注释的菌种有限，高通量测序数据庞大导致获得的大量种属甚至科目都无具体的名称，本研究基于“溯源命名法”将选定的物种重新命名：将没有明确分类学名称的物种（others，uncultured bacterium）向上追溯到属、科、目、纲甚至门水平直至有明确的分类学名称为止，并加注数字编号以便于后续分析（表2）。