《表1 核心SNP位点的分布》
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《油橄榄(Olea europaea L.)核心SNP位点筛选与评价》
为评估核心SNP位点的可靠性,我们首先分析了核心SNP位点的位置分布,发现3 981个(28.18%)SNP位点位于基因间区,而位于基因区的位点有10 144个(71.82%),其中3 896个(27.58%)SNP位点位于外显子区,6 248个(44.23%)SNP位点位于内含子区(表1),与总SNP位点的位置分布保持高度一致性,相关系数R高达0.997,表明核心SNP位点具有很好的代表性。此外,我们还基于总SNP位点信息和核心位点信息,分别计算了全部57个品种间的遗传距离,结果表明两者呈极显著相关(R=0.9**),进一步聚类分析结果也基本一致(图3),显示核心SNP位点具有高度的可靠性。
图表编号 | XD00152812900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.03.14 |
作者 | 朱申龙、牛二利、王伟、施爱农 |
绘制单位 | 浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所、浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所、浙江省农业科学院农产品质量标准研究所、美国阿肯色大学园艺系 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |