《表3 PPO基因家族二级结构基本特征》

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《板栗PPO基因家族鉴定及生物信息学分析》


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利用在线二级结构预测软件SOPMA对板栗PPO基因家族各成员编码蛋白的二级结构进行分析。结果表明,板栗3个PPO蛋白均由α-螺旋、延伸主链、无规则卷曲和β-转角4种结构元件组成(表3),其中含有无规则卷曲353~364个,比例较高,为58.64%~60.97%,该结构常受侧链相互作用的影响,与蛋白质的活性部位构成密切相关。其次为α-螺旋(20.10%~21.10%),再者为延伸主链(15.91%~16.28%),最低的是β-转角(3.02%~3.99%)。