《表1 稻瘟病抗性基因的基因型鉴定结果和采用的引物组合》

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《国外引进水稻种质资源的稻瘟病抗性基因检测与评价》


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R:抗病基因型;S:感病基因型

用SDS抽提法提取水稻基因组DNA[12]。用于PCR扩增的引物相关信息见表1。引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。本研究选取8个稻瘟病抗性基因Pi9、Pi2、Pi5、Pi54、Pikm、Pita、Pia和Pib的引物均为功能性标记。PCR的扩增反应体系总体积为10μL,包括20~100 ng/μL的基因组DNA1μL,2×Power Taq PCR MasterMix(北京百泰克生物技术有限公司)5μL,10μmol/L的上游和下游引物各0.5μL,ddH2O补足至10μL。PCR扩增反应程序为94℃预变性5 mim;94℃变性30 s,退火30 s,72℃延伸,35个循环;72℃终延伸10 min,待降温至16℃即可取出,置于4℃冰箱保存备用。PCR产物在6%非变性聚丙烯酰胺凝胶中电泳分离,4S GelRed核酸染料染色,凝胶成像系统拍照,依据11对功能性标记对应抗性基因片段的大小,参照Marker对扩增条带赋值,判断每份材料8个稻瘟病抗性基因有无。为确保结果准确、可靠,每个样品重复2次以上。