《表1 由训练集分子构建的HypoGen药效团结果》

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《CCR5受体抑制剂的虚拟筛选及体外活性评价》


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注:HBA:氢键受体特征;HBD:氢键供体特征;HY:疏水特征;PI:正离子特征;Null Cost值为369.12;Fixed Cost值为119.41。

利用HypoGen模块,利用训练集中的35个化合物来创建药效团模型,利用训练集分子的结构和活性信息产生的10个药效团模型的特征,包括各模型的Cost值、相关系数因子(r)、均方根偏差(RMSD)和药效团(表1)。Hypo01的Total cost值最低(150.46),接近于Fixed cost(119.41),Fixed cost值与Null cost值为249.61(>80),△Cost值为218.66(>60)。从统计学的指标来看,相对于其他药效团模型而言,Hypo 01具有较好的预测能力且复杂度小。同时从其他的药效团指标分析,Hypo 01具有最大的r(0.95),最低的RMSD(1.26),更加说明Hypo 01优于其他模型,并被选为最优药效团,进入下一步分析。