《表4 预测靶点基因功能富集》

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《当归-菟丝子干预肾虚血瘀型多囊卵巢综合征网络药理学作用机制》


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通过David数据库得到22个共靶点的基因功能GO富集分析(表4)和KEGG信号通路富集分析(表5)。获得GO条目443个,设置参数为P<0.05,FDR<0.05筛选后得到16个,其中生物过程10个,主要涉及一氧化氮生物合成过程的正调控、序列特异性DNA结合转录因子活性的正调控、趋化因子生物合成过程的正调控、来自RNA聚合酶II启动子转录的正调控、对缺氧的反应、转录正调控、DNA模板化、钙调蛋白1-单加氧酶活性正调控、脂多糖介导的信号传导途径、基因表达正调控、细胞增殖正调控;分子功能相关条目4个,主要涉及类固醇激素受体活性、细胞因子活性、类固醇结合、聚合酶II转录因子活性及配体激活的序列特异性DNA结合;细胞组成相关条目2个,包括细胞外空间、细胞外区域。KEGG富集分析得到54条信号通路,设置P<0.01进行筛选,得到20条主要的信号通路如类风湿关节炎、HIF-1信号通路、TNF信号通路、I型糖尿病通路、细胞因子通路-细胞因子受体相互作用通路、NOD样受体信号通路、甲型流感通路、雌激素信号通路、胰岛素抵抗通路、同种异体移植物排斥通路、破骨细胞分化通路、非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)通路等。然后将功能富集结果用EXCEL作成柱状图(见图3);信号通路富集结果采用OMICSHARE(http://www.omicshare.com/)在线工具作出泡泡图(见图4)。同时借助Cytoscape3.7.0嵌合化合物-靶点网络和靶点-通路网络,建立化合物-靶点-通路关系网络图(见图5),其中节点代表化学成分、靶点和通路,边代表两者的对应关系。