《表5 预测靶点信号通路富集》
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《半夏-苍术-香附组药干预痰湿型多囊卵巢综合征的生物机制》
通过David数据库得到23个共靶点的基因功能GO富集分析和KEGG信号通路富集分析。(见表4~5)获得GO条目3206个,设置参数为P<0.05筛选后得到1928个,然后根据涉及靶点数目排序,前41个当中包括生物过程(BP)23个,主要涉及细胞增殖、积极调控生物过程、对刺激的反应、多细胞生物过程、生物过程的负调控、生殖过程、代谢过程、免疫系统过程、微生物过程、细胞成分的组织或生物发生等;分子功能(MF)相关条目6个,主要涉及分子功能调节剂、分子转导活性、催化活性、转录调节活性等;细胞组成(CC)相关条目12个,主要涉及细胞外区域、膜封闭腔、含蛋白质复合物、细胞部分突触等。KEGG富集分析得到126条信号通路,设置P<0.01进行筛选,得到46条主要的信号通路如癌症通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化通路、HIF-1信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、细胞因子与细胞因子受体的相互作用、类风湿关节炎、PI3K-Akt信号通路、IL-17信号通路、AMPK信号通路、TNF信号通路、炎症性肠病(IBD)、1型糖尿病、雌激素信号通路、MAPK信号通路、代谢途径、卵巢类固醇生成、催乳素信号通路、内分泌抵抗、C型凝集素受体信号通路、产生Ig A的肠道免疫网络、胰岛素抵抗、NF-κB信号通路、卵母细胞减数分裂等。涉及通路较多的靶点有INS(55个)、IL6(42)、AR(39)、IL1B(37)、IFNG(33)、VEGFA(21)、INSR(20)、IL2(17)、CCL2(13)、CD40LG(13)、MMP2(10),然后应用OMICSHARE(http://www.omicshare.com/)在线工具作出功能富集柱状图和信号通路富集气泡图。(见图2~3)
图表编号 | XD00194767900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.28 |
作者 | 肖卫琼、袁仁智、康开彪 |
绘制单位 | 甘肃省中医院、甘肃省中医院、甘肃省中医药研究院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |