《表3 凡纳滨对虾16个多态性微卫星位点的遗传多样性信息》

《表3 凡纳滨对虾16个多态性微卫星位点的遗传多样性信息》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《凡纳滨对虾微卫星分子标记的开发及不同养殖家系遗传多态性分析》


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*表示差异显著(P<0.05)

根据鉴定出的39674条微卫星序列,利用Primer 3.0设计39367对微卫星引物。为验证设计的微卫星引物能否通过PCR扩增出微卫星序列,随机选取40对微卫星引物,在桂海1号凡纳滨对虾DNA混池中进行PCR扩增,结果发现有26对微卫星引物能成功扩增出特异性条带(图3),占所选PCR扩增引物数量的65.00%。为进一步验证微卫星的多态性,以筛选出的26对微卫星引物分别对16个不同养殖家系凡纳滨对虾个体DNA进行PCR扩增,PCR扩增产物在ABI 3730测序仪上进行荧光分型(图4),并采用GeneMarker 3.0.0分析分型结果。经微卫星分型后有16个微卫星位点显示出多态性(表3),多态性位点的等位基因数在2~8,共获得67个等位基因,平均Na为4.2个,计算获得的平均Ho为0.511,平均He为0.451,平均PIC为0.489。依据Botstein等(1980)的判断标准:PIC<0.25代表该位点具有低度多态性,0.250.50代表该位点具有高度多态性。在16个微卫星位点中,有2个微卫星位点为低度多态性,6个微卫星位点为中度多态性,其余8个微卫星位点为高度多态性。此外,Hardy-Weinberg平衡检验结果显示有4个微卫星位点偏移Hardy-Weinberg平衡外(P<0.05),其余12个微卫星位点均未偏离Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。