《表5 冠状病毒M蛋白的氨基酸相似性》
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《新型冠状病毒SARS-CoV-2的变异和进化分析》
应用MEGA-X软件构建进化树,导入进化时间信号分析软件TempEst中,分析是否具有进化上的时间信息。如图2A所示,显示有微弱正向进化信号,粗估时钟速率是2.24×10-6substitution/site/day,tMRCA为-131 d,R2=0.08。在此基础上,我们应用BEAST软件进行精细评估tMRCA。如图2B所示,tMRCA平均时间是73.0 d(2019年11月10日),95%可信区间是38.9~119.3 d,后验概率是100%。结果提示病毒的出现日期在2019年9月23日~2019年12月15日之间。这与文献中报道的第1例病例在2019年12月1日出现也是相吻合的。
图表编号 | XD00130964900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.20 |
作者 | 周烨真、张世豪、陈嘉仪、万成松、赵卫、张宝 |
绘制单位 | 南方医科大学公共卫生学院三级生物安全实验室、南方医科大学公共卫生学院三级生物安全实验室、南方医科大学公共卫生学院三级生物安全实验室、南方医科大学公共卫生学院三级生物安全实验室、南方医科大学公共卫生学院三级生物安全实验室、南方医科大学公共卫生学院三级生物安全实验室 |
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