《表2 冠状病毒ORF1ab的氨基酸相似性》

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《新型冠状病毒SARS-CoV-2的变异和进化分析》

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各冠状病毒编码蛋白质ORF1ab、S、E、M和N的氨基酸相似性性如表2～6所示。选用序列MN908947作为参考株进行比较，结果与基因组的核苷酸相似性一致。ORF1ab、S、M和N蛋白与RaTG13、CoVZC45、CoVZXC21相似性最高，其次是SARS-CoV，与MERS CoV相似最低，结合后面进化树分析的结果，在同一亚属内有着高的相似性，不同亚属之间的相似性较低。值得注意的是E蛋白高度保守，SARS-CoV-2与RaTG13、CoVZC45、CoVZXC21完全一致，与SARS-CoV仅有4个氨基酸的差别。