《表1 3种冠状病毒S蛋白基本特征》

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《SARS-CoV-2、HCoV-OC43和HCoV-HKU1棘突蛋白抗原表位分析》

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选取NCBI数据库中收录的65条完整的SARS-Co V-2 S蛋白序列，多序列比对后选取9条S蛋白无氨基酸重复的序列。系统进化树以QHZ87592.1为标准序列，其他8条S蛋白序列共出现8个位点的突变和1个位点的缺失。突变位点分别为R408I、F157L、H49Y、Y28N、A930V、S247R、S221W和F797C，1个位点缺失为Y144缺失。这些突变和缺失均未分布在受体结合域（receptor binding domain，RBD）区域，对S蛋白与血管紧张素转换酶2(angiotensin converting enzyme 2，ACE2）的结合无影响。分别选取AIX10763.1和AYN64561.1作为HCo V-OC43和HCo V-HKU1的S蛋白序列。3种冠状病毒S蛋白基本特征见表1。