《表2 青钱柳与其它物种同源性比对结果》

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《青钱柳鲨烯合成酶(CpSS)全长基因的克隆、分析与表达》

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ORF Finder预测结果表明，克隆得到的长度为1 667 bp的CpSS基因全长序列中包含一个1 245 bp的完整ORF，该ORF编码414个氨基酸，如图3所示。与NCBI中已收录的序列进行同源比对，发现青钱柳鲨烯合成酶基因与胡桃的相似度最高，达97%，与白桦、葡萄、大豆、甘草、可可5种植物的相似度都达到85%。将CpSS所编码的蛋白与其它植物相对比，发现与胡桃、白桦、葡萄、大豆的鲨烯合成酶基因所编码的蛋白同源性在85%以上（如表2）。挑选8个同源性较高的物种，采用Cluster对CpSS的氨基酸序列进行比对分析，发现CpSS基因的氨基酸序列与其它物种有较高的同源区，该区的氨基酸残基的保守性较高。由此推测该区域可能是鲨烯合成酶的功能结构域。